Johann Penner studierte Schulmusik in Weimar und Detmold. Nach der Absolvierung seines Schulmusikstudiums schloss er 2009 erfolgreich sein Gesangsstudium bei Wolfgang Tiemann in Detmold ab.
Als Konzert- und Oratoriensänger ist Johann Penner weit über Detmold hinaus bekannt. Sein Repertoire umfasst u.a. Bachs Johannespassion, Weihnachtsoratorium, zahlreiche Kantaten, Händels Messias, Haydns Schöpfung, Jahreszeiten oder Rossinis Petite messe solennelle und dergleichen mehr. Im Bereich des Musiktheaters wirkte er solistisch bei unterschiedlichen Produktionen mit und sang hierbei u.a. Tamino in Die Zauberflöte, Filipeto in Die vier Grobiane, Max in Der Freischütz und war als Gast im Ensemble des Detmolder Landestheater engagiert. Zum 25. Jubiläum der Deutschen Einheit übernahm er 2015 die Tenor-Partie bei der Aufführung Beethovens Neunter Sinfonie mit dem Sinfonieorchester und dem KonzertChor in Bergisch Gladbach.
Johann Penner hatte von 2009-2010 einen Lehrauftrag für Gesang an der Hochschule für Musik in Münster.